Есть 2 проекта, один на питоне 3.4, второй на 3.9. Возможно как-то в один собрать?

Если библиотеки которые в них используются работают и на 3.4 и на 3.9, то да

-, из-за этого они и написаны были на разных )

Тогда переписывай под нужную версию полностью

Я же уже выше отписал, что библиотеки не работают на одной версии, одна требует 3.4 , вторая 3.9

Решил вопрос использую аналоги библиотек)