Чем можно выкачать сайт?
 

сайт на html, c пхп файлами, картинками, без движка.
C помощью какой программы можно выкачать сайт, сохраняя структуру?

Teleport Pro ;) Скачать(на вирусы не проверял, пробуй на свой страх и риск).