Как организовывать структуру сайта
 

Это не реклама. хочу поделиться с вами ссыкой на ресурс. Что-то вроде уроков на пхп. Один раздел мне очень понравилось и ТАКОГО детального и понятного объяснения не встречал. Это очень важная часть в создании сайтов - создать правильную структуру. ОСОБЕННО это каксается больщих сайтов.
http://php.inkz.ru/kernel/index.php?a=1

типа mvc для самых маленьких) боже упаси по такой литературе учиться... лучше уж вот эту статейку почитать http://habrahabr.ru/blogs/php/31270/ ... хоть там тоже косяков хватает, но на мой взгляд более правильно к вопросу подходят

мое для САМЫХ маленьких и самые основы.Типа как сделать скины.вернее сайт на скинах.

сайт на скинам...мощно сказано

а по поводу новичков... почему новичков надо учить всё делать через жопу?

потму что делать сложное новчков можно научить тока через жопу. (сначала)

большие сайты через жопу делать НЕЛЬЗЯ

надаже с чего-то начинать

харе цеплятся к словам.
короче это простое уководство как сделать сайт на шаблонах. чуть чуть знакомит с вопросом о том что надо задумыватся о структуре сайта.
структура сайта и большого проекта- филосовский вопрос.

+http://php.su/lessons/?lesson_13
про стили програмирования. стили кода.
по этой теме очень мало материала)

не спорь...то что ты про шаблоны говоришь - бред. Сначала херни насоветуют, а потом сидят возмущаются, что школота наговнокодила .. ВОТ http://ru.wikipedia.org/wiki/Pattern

не учи детей плохому... есть СТАНДАРТЫ

1. PEAR Coding Standards
pear.php.net/manual/en/standards.php

2. Zend Framework PHP Coding Standard
framework.zend.com/manual/en/coding-standard.html

3. DB Medialab PHP Coding Standard
www.dagbladet.no/development/phpcodingstandard/

4. PHP coding guidelines
www.evolt.org/article/PHP_coding_guidelines/18/60247/

5. GForge: PHP Coding Standards
gforge.org/docman/view.php/1/2/coding-standards.html

6. Стандарты оформления кода PHP
tony2001.phpclub.net/doc/standard/