как ограничить ресурсы сервера для 1 сайта
нужно ограничить место в 100мб от диска vds
нужно ограничить 1бд и 1 пользователь бд
и граничить потребление памяти рам в 16м для работы скриптов "wordpress"
vds под управлением debian nimimal 5

Создать для него отдельного пользователя и все настройки ставить под него

Обычно вместе с вдс идет панель управления - ispmanager, cpanel - в них все это настраивается через веб-интерфейс, это часто удобнее чем в консоли - все настройки сайта в одном месте

если стоит мультиадмин - там все оч легко.