Пользуюсь пока Азуреусом и Трансмиссионом, в целом хватает, но остаётся впечатление неполноценности и как-то не наглядно
- Обоснуйте свои предпочтения в этом ключе

Трансмиссион вполне хватает, с последним релизом и добавлением magnet вообще красота, пробовал практически все, но если машинка слабовата, самое - то!

Использовал deluge, пока в один день его не заглючило. Удалил, поставил rtorrent+rutorrent(webui).

да, причем не раз пробовал его, и частенько глюки, плюс тяжеловат ну ИМХО очень много лишнего

Качал всегда ktorrent`ом.
Вроде они все на одной либе(libtorrent) работают, кроме ktorrent?

Нет, у rtorrent - libtorrent-rakshasa, а у делюги просто libtorrent-rasterbar, которые общего имеют только название.

Сам пользуюсь ktorrent'ом на обычном компе и rtorrent'ом на тихом неприметном seedbox'e (linksys nslu2)

Ну, если бы даже и на одной библиотеке, это ещё не показатель. Речь то идёт об библиотеке, предоставляющей лишь небольшую часть функций, одной из многих, которые возможно использовать. У бесплатного ПО часто страдает момент вменяемости, автономности, настраиваемости, наглядности - т.е. общей функциональности Как правило, там всё очень лаконично, а иногда и предельно лаконично (командная строка) - то, что называется "не до жиру"... Но, бывают в никс'ах и приятные исключения из этого правила

Сравнивая же то, с чем мне пришлось иметь дело непосредственно - Трансмиссион и Азуреус, последнее во много крат насыщенней возможностями и функционалом по сравнению с Трансмиссионом и даже предусмотрена возможность расширения возможностей внешними модулями.

Использую:
deluge - отлично работает, есть вэбморда, можно писать свои плагины.
fatrat - менеджер закачек с поддержкой торрентов, есть вэбморда, возможность создавать различные очереди со своими правилами.

Ещё есть вопрос, связанный с торент-клиентами, который давно мучает
- И, по секрету, этот вопрос был из ряда ключевых, толкнувших в своё время на полный уход от винды (аки корня всех зол) к никсам , однако и в никсах его пока не решил - плотно и непосредственно не занимался, т.е. просто на него плюнул в своё время и на винду вместе с ним. Но, таки вопрос всплыл и в никсах Итак, сам вопрос:
Какие имеем варианты оптимизировать работу торрент-клиента и избавиться от диких тормозов, связаных с его постоянной работой. Тормоза эти затрудняют параллельную работу с другими приложениями. Таким образом, вопрос - чем пожертвовать в опциях, настройках, которые так грузит процессор?

Какого рода тормоза?
У мну торрент запущен практически круглосуточно - тормозов не замечено.