У меня в системе iptables и ip6tables. Причем сервис iptables остановлен. После применения нового правила в iptables, правило начинает работать. Как это понять ведь iptables же отключен?

iptables некак не отключить ,можно просто открыть весь доступ ,но сам линуксовский файрвол встроен в ядро ))

iptables равно как и ip6tables всего лишь пользовательские утилиты для управления netfilter. netfilter либо вкомпилирован в ядро, либо подгружается модулем. Скорее всего в твоём случае второе. Лучше не отключать а установить дефолтные политики в ACCEPT. Хотя это, конечно, от задач зависит.

Уже разобрался, всем спасибо.