Подскажите, раньше у меня была Windows 7 на ноутбуке и работал Wake on LAN.
Я как приходил домой, запускал специальную софтину на Android смартфоне и ноут включался (ноут подключен через ethernet).

Поставил на этот же ноут Windows 8.1 и теперь не включается ни в какую через WOL. В BIOS настройки не менял.
В чём может быть причина?

Помимо настроек биоса - нужно в настройках сетевой карты включить.

http://winaero.com/blog/how-to-use-wake-on-lan-on-windows-8-1-and-windows-8/

Спасибо, не помогает.

А вот отключение Hybrid Shutdown помогло:
http://support.microsoft.com/kb/2776718