Аналоги PasswordsPro под никсы
 

Что посоветуете многофункциональное на никс системы?

Самый близкий аналог PasswordsPro под никсы, это
#wine PasswordsPro.exe
про скорость только ничего сказать не могу т.к. запускал только на виртуалке.

На домашней страничке JTR посмотри на Contributed resources.
Например, в jumbo patch входит много всякой лабуды вроде сальтованых MD5, NT, MySQL

На-ка вот.
_http://www.securitylab.ru/software/1265/