Пример протекции Php
 

Собственно, может кто нибудь показать кусок Php скрипта по котором упрошлись протектором.

http://pastebin.org/30823

Благодарю, а ещё "До" и "После" можно пример?

это и есть после.

кстати, маднет деобфускатор под такую хрень делал вроде

К эксплойтам подобная методика применяется?

Ога, TrueBug. Мощная штука
http://madnet.name/news/21.html

для пхп - чтобы хостер на сервере не нашел.
для js - от антивирей, хотя помогает не всегда