Скачивание сайта
 

Есть сайт.
Висит на 443 порте. Протокол https
При заходе на сайт автоматически вылазиет авторизация по .htaccess
С помощью какой проги можно слить весь этот сайт?

Опиши получше.... или еще лучше, дай линк

Не знаю какой сайт. Попробуй может Offline Explorer

по-идее так:

wget https://site -r -l 0 -p

если с авторизацией, то
wget https://site --http-user=USER --http-password=PASS -r -l 0 -p