Ну дык, конечно же медленнее, вместо того, чтобы одним махом прочитать 300Мб, дергать винт за каждой порцией... Здесь просто нужно еще найти среднепривлекательный размер этих порций, тогда задержка, вызванная работой с диском уменьшится... Я думаю, порции порядка 20-30Мб - вполне приемлемы... Главное, потом сделать более или менее оптимальный алгоритм разбора полученного массива, чтобы он не делал лишних действий и беганий...