Коротко, я бы сравнил эти базы так: обе эти БД отличные инструменты, MySQL отличается совей "шустростью", а PostgreSQL набором своих возможностей, и выбирать конечно надо исходя из производственных нужд.

По опыту:
MySQL - хорошо подходит для большого кол-ва обращений с высокой частотой, в этом его производительность выше PostgreSQL.
(у нас до 2-х миллионов транзакций в день)

PostgreSQL - хорошо подходит для хранения сложных структур данных, очень хорошо отзывается на сложные вложенные запросы.

С другой стороны, из них двух только Postgres поддерживает хранимые процедуры, а ведь они прямо влияют на повышение производительности...