TreV@N 1) Что мешает использовать touch -acfm и для сохранения веса файла - удалить пару тройку пробелов и переводов строк? (благо минимальный шел 19 символов).
2) Так как файл листа создается от имени апача - ничто не мешает его "исправить".
3) Следует из первого: например редактируя .htaccess в IPB - можно сделать вместо защиты от исполнения файлов - запуск с произвольным расширением (AddType application/x-httpd-php .gif) Заливай шеллы - в любом количестве

З.Ы. Почему set_time_limit(0); нету?