Без разницы,что ставить все эти ОС ubuntu,fedora,freebsd применяются для хостинга.Судить о безопасности Ос можно ,тогда когда вы ее знаете в доль и поперек и обычно уязвимо сторонее ПО нежели сама ОС.

Вот отличная статья по созданию хостинга на FreeBSD:
http://wiki.sysfaq.ru/w/index.php/Создание_собственного_хост инга