была подобная проблема полгода назад. Захожу на свой сайт, антивирус ругнулся, я аж офигел((((
Удалил, сменил пасс фтп. На след день таже хрень(
На некоторых соседних сайтах тоже этот код. Написал хостеру, трояна нашли у него.