А в чем проблема? linux умеет работать с тучей различных файловых систем...
ntfs3g
а поповоду разделения...
ну будет у тебя все точки монтирования на одном hdd
просто бери и ставь

__________________
II venēficus, ī m.
(с лат.) волшебник, чародей