Если прятать процесса - это ппц палится и выясняется банальным перебором PID'ов процессов и попыткой их открытия и сравнение результата с реально отображаемым процессами, так что такое ленивый даже спалит. Другая сторона - скрыть процесс именно для стандартного диспетчера задач. Есть гдето DLL которая это делает.
С теоретической реализации - это банальное слежения за окнами и если найдено окно диспечера задача, то находится поле отображения процесса (типа листбокс) и постоянно оно преезписывается (чаще чем стандартно) и от туда выкидывается имя своего процесса.

<offtop>
Если я не ошибаюсь то Ms-Rem погиб в автокатастрофе
</offtop>