Тем не надо "ядерную энергию или реактор". Необходимую мощность дает подрыв обычного ВВ -часть энергии взрыва переходит в ЭМВ. Банальное уменьшение размеров объемного резонатора - при необходимой скорости схлопывания оного, сила ЭМВ возрастает сильно. Дальше идет уже разрушение резонатора и ЭМВ выходит наружу. ЭМИ очень короткий, но его вполне хватает для пробоя радиокомпонентов. Экранирование поможет, до какой-то степени, но наружу антенна все равно ведь выведена. Традиционная защита разрядниками иои быстродействующими ключами не всегда дает нужный эффект - импульс слишком короток.
Кстати, во время войны в Персидском заливе применялись подобные ракеты для уничтожения радиолокаторов - но не все погибали, ибо там еще многие локаторы были постройки времен СССР - на лампах. Лампа очень малочувствительна к такому - максимум, что будет, это пробой внутри лампы и дальше локатор будет действовать снова.