Nightmarе, HTTP-Аутентификация работает если пхп прикручен, как модуль Apache'a. Если как cgi-обработчик - тогда никак.
Сделал небольшое сравнение. Вывел массив $_SERVER на 2х серваках (1 - модуль, 2 - cgi)
В первом случае REQUEST_URI, SCRIPT_NAME совпадали. Во втором SCRIPT_NAME - путь до пхп. + во втором случае был еще 1 параметр: [REDIRECT_HANDLER] => php-cgi.

Можно еще посмотреть в phpinfo параметр Server API.

+ если модуль, тогда есть функции для работы с сервером Apache
http://ru.php.net/manual/ru/ref.apache.php
Те можно просто проверить через function_exists.