Нужен менеджер работы с разделами. Acronis или Paragon или Partition Magic.

1) Возможно, неправильно выставлены перемычки, если отдельный хард.
2) Возможно, подключаемый раздел - Primary, один Primary система показывает, а второй - нет, выставляя ему режим hidden.