Убить процесс может тот, кто его запустил и root (гитарист слипкнот #4).
Если ты запустил сокс с веб-шелла, то чаще всего, с правами апача, тогда и убить его можно также с веб шелла... Если ты запустил сокс из рут-консоли, то убить его с веб шелла нельзя (конечно, если веб сервер не под рутом запущен - а такое было)