Сервис будет перезапущен (если ты код смотрел),
а оставлять лишнюю запись в реестре имхо палено т.к в там и в правилах файрвола остается полный путь к экзешнику. Идеальным вариантом будет использование пары RegSetValueEx и RegDeleteKeyEx каждый раз когда данные должны посылаться в обход файрвола.

-> я же предложил грубую альтернативу, это что провокационный вопрос или желание попинать ногами?