сервер на никсах?
смотри тщательно процессы. Все эти дела может запускать простенький скрипт, фопеном грузить откуда-то то, что надо и все..раз в час или в другой промежуток времени. вобще выставь r-r-r на индекс.пхп, а еще лучше човни индекс другим юзером)) и права на запись потом уже убери.корень не забудь тоже.