Для шифрования файла/папки достаточно активировать данное действие в свойствах объекта, при этом в профиле пользователя будут созданы соответствующие ключи с помощью которых и осуществиться шифрования.

В случае утери профиля пользователя или других непредвиденных обстоятельствах следует помнить что система EFS создает копию сертификата и дарит его Администратору.

P.S.> Advanced EFS Data Recovery снимает на раз