попробуй упаковать в архив и так залить, хз может поможет.
Попробуй так же залить не через панель, а напрямую по ФТП, может в таймлимит твоего сервака не укладывается скрипт, и не докачивает твоя новая панелька файл.
П.С. может еще по каким-либо ограничениям не проходит файлик твой, короче попробуй напрямую залить по фтп сначала