cat /dev/null > /dev/sda [hda] в линуксе. Вроде так можно, хотя не уверен.
Еще можно через dd

ну и на флешку линукс легко залить, (с помощью какого нибудь syslinux'а или вобще скачать готовый образ, они весят около 30мб).