Можно ломануть shadow. John The Ripper решит проблемы.
Также по теме, если ты слил shadow, это возможно из-за двух косяков: a) права на чтение были выставлены также и для группы, с которой запущен сервер ftp, либо для всех вообще; b) сервер ftp был запущен под root (это более вероятно), не сконфигурирован для работы через pam и т.п.
Плюс к выше сказанному, судя по всему, еще сервер криво сконфигурирован, либо наоборот хитро и ты скачал левый shadow.