wget --mirror www.site.ru

sudo apt-get install filezilla

filezilla

Остается только авторизоваться на серваке (а мог бы еще написать консольную авторизацию) и перетянуть слитую wget'ом папочку.

Иначе, как уже сказал BlackSun, иди жми гламурные кнопочки.