К сожалению(к счастью мб?) я не работаю в Я, но так на вскидку и по своим наблюдениям за моими сатами - АГС проходится после попадания страниц в индекс - и если есть уж очень релевантные паги - получаем под дых, но это лишь мое предположения и не более, и опять же повторюсь - лично на мои доры АГС никак не влияет - они заходят полностью в индекс и вылетают так же полностью без единой страницы в индексе в итоге, фришки сейчас не юзаю вообще.