Сам сколько всем так твердил что моно достойная замена .NET на никсах. Но сколько я уже пробовал программ написанных на .NET ни одна ещё не запустилась.
Поэтому теперь стоит .NET Framework под Wine'ом. Моно даже старые приложения написанные на .NET 1,2 не тянет, что говорить про 3.5.
А если писать на Mono, то в вынь его нужно тянуть с собой(попробуйте запустить monodevelop на винде без mono. помню была статья в ксакепе очень умного .net'чика, который не смог запустить monodevelop под вындой и написал что это сакс и т.д. хотя в mono помимо m$ классов есть и свои и сторонние библиотеки CSharpZlib, Novell,GTK,DBUS,etc которые monodevelop и юзает).

P.S. лучше C++ вместе с Qt4 ничего ещё не видел