Лазая по своим старым скриптам, напоролся на этот продукт -- Инспектор файлов. Это несколько модулей для vBulletin, при помощи которых можно сохранять в базе данных список существующих файлов и время от времени проверять, не изменились ли какие из них (для каждого файла сохраняется размер, владелец и права доступа) -- встроенная cron-задача уведомит администратора по почте о найденных несоответствиях. Можно сохранять в БД несколько различных копий (ревизий) списков файлов для сравнения (автоматическая проверка с уведомлением на email сверяется только с последней ревизией). Внешний вид и доступные настройки можно посмотреть на скриншотах.

INSTALL: Для установки необходимо залить два PHP-файла из архива на сервер и импортировать продукт из файла "product-gfi.xml".

UPDATE: Обновление версий не предусмотрено, так что для установки новой рекомендуется сперва удалить предыдущую версию.

З.Ы. Продукт успешно работал на всех версиях от 3.6.8 до 3.8.1 включительно. Правда ссылка в выпадающее меню в панели навигации добавлялась в разные места, но это уже мелочи.