Ну ябы сделал на говнокоде так:
Открываем файл,читаем до первого "\r\n" или аналога(не суть важно),далее счетаем количество символов в строке,переводем в байты,считываем строку,сравниваем с аналогом во 2 докуменнте.В общем мы теряемслишком дохера времени.Проше установить линукс и заюзать дифф