Попробуй просканить ещё 1-2 антивирусами.. так как Авира - не даёт гарантии на 100%.. да хотябы на 60% излечение от вирусов.. проскань например: Dr. Web'ом и Касперским... по любому, что нибудь найдётся.. Лично я сталкиваюсь с такой проблемой (зависание мыши и клавы - 1 раз).. а по поводу Безопасного Режима. Бывает, что он может грузиться - 20 мин. хотя - это уже плохо.

Хм.... да и ещё.. а как ты определил, что у тебя комп работает нармально?.. Если у тебя И мышь и Клава - виснут? по лампочкам ?