2DIAgen ну конечно он и не должен работать тк ; в кавычках и каментах тоже обрабатывается. то что дал там если код помсотреть :
//mysql_query($zapros,$mysql_link);
echo '"'.$zapros."\"\n";
заменяем на
mysql_query($zapros,$mysql_link);
// echo '"'.$zapros."\"\n";
и все корректно обрабатывает. ну и set_time_limit в начало суем