Хммм... я видел лишь 1-2 подобных "компилятора" и все они заточены под вин. Только вот в чём трабла - после компиляции для запуска .exe нуна куева туча библиотек =_=.

Пример компиляторов:
http://forum.eugen.su/showthread.php?t=81 - тру
http://www.bambalam.se/bamcompile/
http://www.exvision.net/miniphp/ - тру
http://www.roadsend.com/home/index.php
и ещё php2exe (первая попавшая ссылка - http://filez.kilu.de/php2exe.rar)

п.с. А это не есть гуд =_="
п.с.с НЕ знаю как вам, а по мне на пчп можно реализовать всё то или частично, что перечислено в определение вируса(который с вики). НО под одним условием, это будет сам парсер php.exe + библиотека(и) + скрипт.