2 Matnya когда файл инклудишь, то сначало на серваке он загружается, в нем выполняется скрипт и только потом начинается отдача файла. Ну или параллельно идет отдача и обработка, но по любому скрипт успевает обработаться (но это редко).
По этому можно не беспокоиться что шел в конце. Такая фишка будет работать в 99% случаях.