Просто опыт: некоторые дешевые корпуса бывают настолько кривые, что, просто так воткнув видеокарту, получаешь в большинстве своем эти самые "1 длинный и 2 коротких". Т.е. корпус "выдергивает" видеокарту. Особенно на AGP (мало ли). Дело доходило до приклейки видеокарты расплавленным полиэтиленом (клеевой пистолет). Либо ломался (гнулся) контакт в самом разъеме на материнской плате, если ставить видеокарту неумело (или второпях).
Если все ровно - я начал бы с проверки самой видеокарты на другом компьютере.