ДА сделайте скрин плиз, как это должно выглядит.
У меня остались главные вопросы....
1. Менять скрипт надо? Если я правельно понял, то скрипт должен поменять под себя. А именно - первая строчка "#!/usr/bin/perl", поменять на "C:\Perl\Perl\bin\perl"?
2. cmd именно так должен выглядит???

Да киньте сыслкой, как организовать дос.

Я профан вы этом деле, так что особо не ругаться...