Имеется скрипт, в котором в начале:
Скрипт был запущен, а потом где-то зациклился. В итоге имеем скрипт, который висит в памяти и что-то делает. Возможность выхода в нем предусмотрена, но зациклился он до этой проверки. Как его теперь, лол, остановить?
Рестартнуть апач - не выход.