проблема скорее всего именно в нехватке прав, попробуй найти что-нибудь кроме /var/www/cgi-bin

что-нибудь вроде

locate default

и попробовать поискать что-то такое:

ScriptAlias /cgi-bin/ /usr/lib/cgi-bin/

может быть не только из /var/www/cgi-bin можно выполнять