http://webmaster.yandex.ru/
http://www.rambler.ru/doc/add_site.shtml
http://www.google.ru/intl/ru/addurl.html

Примечание. Некоторые туда свои сайты просто так суют, с них ссылки не будет, так что не говорите, что не предупредил. Некоторые вообще в бане. Так что проверяйте.