1) Проверь ключи реестра связанные с загрузкой шелла. (Возможно он пропал) ибо:
как раз такие симптомы, только без завершения работы.

2) Снеси к чертям комод (Live CD в помощь) ибо: может и он виноват тк не дает запуститься шеллу (чем черт не шутит хотя понимаю, что бред)

3) Попробуй поменять userinit.exe и explorer.exe

Если это не поможет, то я буду еще долго думать :-)