Для начала:

1) Вы уверены, что скорость режется по портам? Может быть просто включили приоритет на пиринговый траффик?

2) Вы пробовали использовать в настройках торрент-клиента опцию шифрования траффика и порт 80?

3) На сайте провайдера это написано, или вы выяснили это опытным путем?

4) У других пользователей провайдера наблюдается эта проблема?