В SPL уже есть вполне рабочие методы для работы с файлами.
Например, При работе с рекурсивным просмотром директорий(RecursiveDirectoryIterator).
Хорошее описание есть в офф манах. Да и всякой всячины там полно, и работать удобнее. Если что-то не так, то выведет соответствующую ошибку, которую можно отловить теми-же исключениями, опять же из spl
Описаловка тут:
http://www.php.net/~helly/php/ext/spl/classRecursiveDirectoryIterator.html
//правда нужен php5, если память не изменяет.