Да действительно, они не подумали, о такой возможности, хотя в реализации, они вряд-ли столкнулись бы со сложностями, напиши им придложение в сапорт, вдруг их заинтересует. Есть несколько методов:

1) Установить программу, создающие виртуальные зашифрованные диски, и создать виртуальные диски самой Vmw на это виртуальном диске.
2) Vmw поддерживает загрузку из сети, можно создать сервер, включающийся только по паролю и грузить её с него.

Эти методы снизят, и так низкую, производительность самой Vmw, примерно 2-4 раза, но чтож поделаешь, параноя тредует жертв

3) Vmw использует драйвер для прямого доступа к физическим дискам, можно разобрать его структуру и переписать или пропатчить его так, чтоб никто другой не смог прочитать то, что он запишет на физ.диск, этот метод практически не снизит производительности, но для его реализации, ты должен уметь писать драйвера.