В общем виде, нет.
У тебя поменяются все смещения и прочая дрянь, и там, где их не распознал дизассемблер, будет бред и EXE работать просто не будет.
Нужно будет хорошо посидеть с листингом, чтобы он нормально работал.
А вообще, есть хорошая пара асм/дизасм - nasmw/ndasmw.