target.com/ - я залил на сервер, в домашнюю папку пользователя. К виртуальному хосту target.com он не относится никаким боком, кроме того что сидит там же.

ip-addr/~username/shell.php, спасибо, выглядит подходяще, попробую, но в конфиге апача UserDir disabled