допусти у тебя это в переменной $stroka а твое domain=vasya.com; path_spec;
version=0 в переменной $z3

$z1=substr($stroka,0,70) # будет 'Set-Cookie3: roton=MXwwfDExNjg2MDAzODV8MTE2ODYwMDM4NXwwO25vcmVm X2lu;'

$z2=substr($stroka,71,118) # будет 'expires=Sat, 13 Jan 2007 11:13:05 GMT; path=/;'

и потом соединяем $gotovo="$z1$z3$z2"