PuTTy - утилита для соединения с серверов по протоколам: SSH, telnet, rlogin, raw =>
=>тебе нужно знать не комманды PuTTy, а знание SSH, telnet, rlogin, raw.....
telnet:запускаешь его из cmd и набиваешь help.
rlogin&telnet:http://www.soslan.ru/tcp/tcp26.html
SSH:http://www0.opennet.ru/links/info/829.shtml