Максимально убогий и тошнотный синтаксис, огромное количество сторонних модулей, которые требуются для работы; язык менее популярен в сфере веб-разработке; да и, более того, PHP 8 с JIT-компиляцией обгоняет его по скорости работы. А в том, что PHP используется для создания API, нет абсолютно ничего странного - большая часть из всех существующих на данный момент REST API работают как раз на PHP. Возьмём даже тот же ВКонтакте. А если есть необходимость запускать PHP код вне веб-сервера, то на помощь приходит JPHP, который позволяет запускать PHP код через Java VM.